Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd7P50283 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd7P50283 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd7P50283 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd7P50283 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd7P50283 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd7P50283 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd7P50283 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd7P50283 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd7P50283 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd7P50283 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd7P50283 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd7P50283 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd7P50283 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd7P50283 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd7P50283 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd7P50283 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd7P50283 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms