Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms