Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psen1P49769 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psen1P49769 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms