Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx3P48759 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms