Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GdnfP48540 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms