Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox2P48432 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox2P48432 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox2P48432 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms