Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VdrP48281 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VdrP48281 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
VdrP48281 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VdrP48281 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms