Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrprbP47758 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrprbP47758 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrprbP47758 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrprbP47758 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms