Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax9P47242 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax9P47242 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax9P47242 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pax9P47242 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax9P47242 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pax9P47242 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms