Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nedd4P46935 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nedd4P46935 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms