Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx2P43241 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx2P43241 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdx2P43241 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdx2P43241 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms