Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtgfrP43117 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms