Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NodalP43021 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NodalP43021 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NodalP43021 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NodalP43021 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NodalP43021 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms