Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-2P42586 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-2P42586 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-2P42586 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-2P42586 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-2P42586 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkx2-2P42586 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-2P42586 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms