Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Elk1P41969 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elk1P41969 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elk1P41969 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms