Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc19a1P41438 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc19a1P41438 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms