Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LtbP41155 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LtbP41155 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtbP41155 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtbP41155 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtbP41155 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LtbP41155 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LtbP41155 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LtbP41155 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbP41155 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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