Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl28P41105 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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