Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VhlP40338 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VhlP40338 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VhlP40338 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VhlP40338 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VhlP40338 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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