Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd1P40201 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd1P40201 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd1P40201 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd1P40201 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd1P40201 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd1P40201 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms