Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtlP38585 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtlP38585 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtlP38585 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtlP38585 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TtlP38585 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms