Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lig1P37913 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms