Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ptpn1P35821 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ptpn1P35821 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms