Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddit3P35639 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddit3P35639 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms