Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola1P33609 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola1P33609 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms