Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc5P32043 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms