Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PrkcdP28867 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms