Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Celf1P28659 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Celf1P28659 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Celf1P28659 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Celf1P28659 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms