Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DcnP28654 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DcnP28654 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DcnP28654 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DcnP28654 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DcnP28654 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DcnP28654 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms