Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col2a1P28481 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Col2a1P28481 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms