Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd10P28359 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd10P28359 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd10P28359 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms