Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd9P28357 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd9P28357 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms