Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LoxP28301 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LoxP28301 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LoxP28301 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LoxP28301 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LoxP28301 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LoxP28301 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LoxP28301 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LoxP28301 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LoxP28301 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LoxP28301 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LoxP28301 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LoxP28301 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms