Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabrg3P27681 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabrg3P27681 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms