Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2afxP27661 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms