Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd40lgP27548 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms