Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U2af2P26369 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U2af2P26369 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
U2af2P26369 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
U2af2P26369 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms