Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CftrP26361 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CftrP26361 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CftrP26361 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CftrP26361 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CftrP26361 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CftrP26361 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CftrP26361 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CftrP26361 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CftrP26361 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CftrP26361 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CftrP26361 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CftrP26361 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CftrP26361 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CftrP26361 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CftrP26361 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CftrP26361 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CftrP26361 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CftrP26361 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CftrP26361 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CftrP26361 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CftrP26361 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CftrP26361 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CftrP26361 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CftrP26361 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CftrP26361 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CftrP26361 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CftrP26361 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CftrP26361 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CftrP26361 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms