Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccnd1P25322 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnd1P25322 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms