Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdk11bP24788 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk11bP24788 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk11bP24788 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms