Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd12P23812 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms