Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f1P21952 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f1P21952 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms