Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpcP21841 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SftpcP21841 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SftpcP21841 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SftpcP21841 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SftpcP21841 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SftpcP21841 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms