Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lmnb2P21619 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmnb2P21619 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms