Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnc2P20801 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms