Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkcaP20444 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms