Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ifrd1P19182 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms