Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnnc1P19123 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms