Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rps6ka3P18654 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps6ka3P18654 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms