Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18532 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P18532 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18532 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18532 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P18532 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P18532 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18532 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18532 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18532 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms